Chaque année, en alternance entre les rencontres de virologie végétale (année impaire) et les rencontres de phytopathologie-mycologie puis plantes-bactéries (année paire) qu'elle organise, la SFP remet des prix aux doctorants. Ces prix récompensent respectivement la meilleure communication orale et le meilleur poster. Ils sont également remis tous les trois ans lors de la tenue du colloque de la SFP.

Janvier 2018: Prix attribués à l'occasion des Journées Jean Chevaugeon 2018 à Aussois (16-19 janvier 2018).

Le prix de la meilleure communication orale a été attribué à Margot Bärenstrauch (Laboratoire MCAM, UMR 7245 CNRS-MNHN) pour son exposé intitulé "Down-regulation of the mycotoxin beauvericin in a phytopathogen-endophyte interaction". Le prix du meilleur poster a été attribué à Justine Colou (UMR 1345 IRHS, Université d’Angers-INRA-Agrocampus Ouest) pour son poster intitulé : "Implications de complexes protéiques membranaires, les eisosomes, lors du processus infectieux chez Alternaria brassicola". Les lauréats, croqués ci-dessous par Mélanie Roy (Université Paul Sabatier), ont reçu un exemplaire de l’ouvrage « Jamais seul » (Marc-André Selosse, Actes Sud).

Janvier 2017: Prix attribués à l'occasion des Rencontres de Virologie Végétale à Aussois (15 au 19 janvier 2017).

Le prix de la meilleure communication orale a été attribué à Coralie Picard (INRA Montpellier) pour son exposé intitulé "Influence of landscape characteristics on the optimal control of a plant virus". Le prix du meilleur poster a été attribué à Julie Kubina (IBMP Strasbourg) pour son poster "Nuclear export of Cauliflower Mosaic Virus mRNAs in A. thaliana".

Janvier 2016: Prix attribués à l'occasion des Journées Jean Chevaugeon 2016 à Aussois (25-29 janvier 2016).

Le prix de la meilleure communication orale a été attribué à Yohann Petit (UMR Bioger Grignon) pour son exposé intitulé "A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus". Le prix du meilleur poster a été attribué à Miriam Gatti (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay) pour son poster intitulé : "Detoxification of mycotoxins: a source of resistance to Fusarium head blight in cereals, from Brachypodium distachyon to bread wheat". Les lauréats, croqués ci-dessous par Mélanie Roy (Université Paul Sabatier), ont reçu un bon d'achat d'un montant de 100€ pour des ouvrages des éditions Quae.

Juin 2015: Prix attribués à l'occasion du congrés de la SFP à Colmar (2 au 5 juin 2015).

Le prix de la meilleure communication orale a été attribué à Léa Ackerer (IBMP Strasbourg) pour son exposé intitulé "Nanobody-based products as diagnostic tool for grapevine fanleaf degeneration". Le prix du meilleur poster a été attribué à Sayuj Koyyappurath (CIRAD) pour son poster : "Root colonization patterns of Fusarium oxysporum f.sp. radicis-vanillae in susceptible and resistant genotypes of vanilla".

Janvier 2015: Prix attribués à l'occasion des Rencontres de Virologie Végétale à Aussois (18-22 janvier 2015).

Le prix de la meilleure communication orale a été attribué à François Berthold (CNRS Strasbourg) pour son exposé intitulé "Grapevine fanleaf virus replication: viral proteins and host factors". Le prix du meilleur poster a été attribué à Loup Rimbaud (CIRD) pour son poster : "Managing plant epidemics: identification and estimation of key parameters to optimize control strategies".

Janvier 2014: Prix attribués à l'occasion des Journées Jean Chevaugeon 2014 à Aussois (25-29 janvier 2014).

Le prix de la meilleure communication orale a été attribué à Mathilde Malbreil (UMR LRSV Toulouse) pour son exposé intitulé "Trojan horse strategy and fair trade among symbioses: how one fungal species can invade thousands of plant species with their agreement?". Le prix du meilleur poster a été attribué à Yacine Badis (UMR LRSV Toulouse) pour son poster intitulé : "Identification de gènes et de mécanismes moléculaires de la légumineuse modèle Medicago truncatula impliqués dans la résistance partielle à Aphanomyces euteiches".